Коллекция единственного в мире Музея В. В. Набокова формировалась в необычных условиях. После национализации дома и имущества семьи Набоковых в 1917 году наиболее ценная часть художественной коллекции и книжного собрания была передана в музеи и библиотеки России.
К счастью, некоторая часть документов и фотографий сохранилась в зарубежных частных архивах родственников В.В. Набокова. Кроме того, часть предметов быта из дома Набоковых была сохранена в семьях петербуржцев, работавших в доме Набоковых.
Основу коллекции музея составляют личные вещи писателя, предметы быта из дома Набоковых, предметы эпохи, фотографии семьи, коллекция бабочек, собранная В.В. Набоковым, первые, прижизненные и современные издания произведений писателя на разных языках, среди которых так называемый «самиздат» 1960-1980 гг.
Фонд бытовых предметов
Основу фонда составляют мемориальные предметы, принадлежавшие Владимиру Набокову и его семье.
Многие из них были переданы сыном писателя — Дмитрием Владимировичем Набоковым.
Фонд книг и периодических изданий
В фонде представлены первые издания произведений Владимира Набокова, многие из которых имеют автограф писателя. Отдельный интерес представляют книги из библиотеки отца автора, эмигрантские периодические издания, редкие современные издания произведений Набокова на разных языках.
Фонд рукописей и документов
В фонде хранятся черновики, письма и другие документы, принадлежавшие Владимиру Набокову и членам его семьи.
Фонд фото- аудио-, видео- материалов
В коллекции музея представлены оригинальные фотоснимки, на которых был запечатлён Владимир Набоков и члены его семьи.
Фонд изобразительных материалов
В фонде представлены работы известных художников, посвященные творчеству и жизни Владимира Набокова.
Энтомологическая коллекция
Основу энтомологической коллекции музея составляют бабочки, собранные Владимиром Набоковым в США в период с 1941 по 1960 гг. Дополняют коллекцию образцы, переданные Зоологическим институтом Российской академии наук.
